A mí me sucede los mismo desde que actualicé a D2+ 3.11; con la versión 2.57 no me pasaba.

El problema ocurre al añadir nuevos archivos en la tarjeta o al borrar archivos desde el D2.

La única forma que he encontrado de solucionar esto  es apagar y encender el D2 dos veces, tras esto la base de datos queda corregida.

De momento es la única posibilidad hasta que salga un nuevo firmware que lo solucione.